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上饶中等职业学校的毕业证书和普通高中毕业证书在效力上有所不同。普通高中毕业证书通常代表学生完成了基础教育的全部课程，而中职毕业证书则证明学生完成了某一特定职业技能的培训。因此，两者的教育和目标不同，其效力也不相同。至于具体的效力程度，还需结合用人单位的实际需求和当地的就业市场来确定。因此，不能简单断言两者具有同等效力。